根治灰指甲要使用抗真菌药物，包括内服、外用，要保证足够的疗程。灰指甲医学上称为甲癣或者甲真菌病，由皮肤癣菌或者其他致病真菌感染甲板还有甲下组织所致。灰指甲之前较难治疗，但目前已经有较多有效、安全的药物可以治疗。比如较轻的灰指甲，可以考虑外用药物比如阿莫罗芬搽剂、环吡酮搽剂等能够透甲吸收，杀死指甲里面的真菌，只要遵医嘱按疗程使用，可以将灰指甲治愈。
比较严重的灰指甲可以考虑口服伊曲康唑、特比萘芬抗等真菌药物，经过多年临床验证也安全有效。一般需要大概3-6个月的时间，才能将灰指甲中的真菌彻底杀灭达到根治，如果疗程不够，有时灰指甲容易复发。另外，在用药物治疗的同时还要注意清洁卫生，包括鞋袜等要勤洗、勤晒、勤消毒，脚部也要注意清洁，避免潮湿、多汗，综合起来一般能够将灰指甲根治。
