儿童系统性红斑狼疮是十分复杂的疾病，全身多器官、多系统都能引起损伤。狼疮脑病可以引起死亡，该病还可以引起心包炎，同样可以引起死亡。狼疮引起的肾衰也可以引起死亡，狼疮后全身多器官多系统损伤比较严重，因此还可以出现感染。

狼疮感染对于儿童的死亡率非常高，其可能是死亡里相对较多的病因。近年来狼疮死亡率比较低，是因为狼疮抗感染治疗比较有效。在过去没有多种抗生素可用于治疗，现在治疗狼疮原发病的方法也与原来不一样，所以狼疮预后跟原来有明显改善。

治疗的目的是让狼疮病人像正常人一样生活，可以上学，结婚，甚至生育，但是狼疮患者的死亡病因主要是多器官、多系统损伤引起的感染，也可能是同时多个器官损伤衰竭而引起死亡。