肛周脓肿自行溃破后也能够愈合，以后不再复发的病例很少，这和脓肿的表浅、患者后期保养是否得当都有关系。肛周脓肿自行破溃后再复发的病例是大多数，这是由于肛周脓肿的原发病灶得不到根治所致，肛周脓肿原发病灶部位是一个特殊结构，称为肛窦，肛窦是开口向上的窦状结构，很容易存留粪便，肛窦内有肛腺，通向肛门周围组织，肛腺属于内分泌腺，一旦存留粪便就容易感染形成肛周脓肿。
因此，肛周脓肿破溃后，虽然脓腔内脓液能够排出来，但肛窦内感染病灶难以去除，也就是原发病灶不能根除。这就是为什么肛周脓肿自行破溃后虽然愈合，还会复发的原因，需要采取措施，根除原发病灶，才能够根除疾病。
