肛周脓肿可分为很多种，包括皮下脓肿、坐骨直肠窝脓肿、直肠周围脓肿、直肠后间隙的脓肿。如果是皮下脓肿，切开引流或者做肛周脓肿一次性根治手术，患者可能一周后能够完全痊愈。
但是坐骨直肠后间隙或者骨盆直肠间隙脓肿，切开引流以后会形成高位、复杂肛瘘。而高位、复杂肛瘘形成以后如果不做肛瘘手术，肛周脓肿会反复发作，很难能够愈合。做完高位、复杂肛瘘的手术以后，愈合时间根据范围和深度也是有很大差异。一般坐骨直肠窝脓肿形成高位肛瘘大概有可能愈合，时间在35-40天。如果是更高范围的、更大的脓肿，患者可能需要6-12个月愈合。
