龟头上如果出现水疱，常见为龟头疱疹，疱疹病毒感染后可引起水疱的出现，需要进行抗病毒治疗。为明确诊断，常使用水疱的液体进行病毒检测。

有些患者因包皮过长且包皮内存在炎症刺激龟头，从而导致发炎、发红、发痒，甚至出现水疱，通常为细菌感染所致，此时可以通过外涂或口服抗生素、包皮环切，减少细菌感染，此后龟头发红、水疱等症状则会消失。总之，男性龟头上出现水疱多数是良性疾病，与龟头恶性肿瘤存在明显区别。