碱性磷酸酶和总蛋白都是反映肝脏功能状态的重要指标，当碱性磷酸酶和总蛋白都偏低时，提示患者肝脏功能受到因素的影响，出现功能障碍。当患者出现症状后，医生的责任就是帮助病人找到病变原因，通过后续治疗使患者的症状得到有效地改善，以及指标得到有效地恢复。
常见引起肝功能损害的原因，包括内性的原因，如病毒、酒精、药物的不良使用，而外科性的原因，如胆石症、胆管的肿瘤，或者是肝细胞的肿瘤，可以导致胆汁排放不畅，引起梗阻性的黄疸，从而使肝脏的功能受到一定的抑制和破坏。
患者通过检查发现病因后需要通过病因对症治疗，以及对病因的根本治疗，如抗病毒、戒酒、保肝、护肝。患者可以使用异甘草酸镁、还原型谷胱甘肽等，或者是通过外科手术取尽结石，切除肿瘤使数值得到有效恢复。
