下咽癌目前仍依赖于手术治疗，但化疗、免疫治疗与靶向治疗方面也有一定进展，包括下咽癌在内的头颈部肿瘤，靶点较少。如果未出现复发或转移的难治性下咽肿瘤，通常不建议选择靶向治疗。

一旦出现复发或转移，会优先推荐患者行基因检测，从中找到靶点。对应的靶点可借鉴其它瘤种，比如肺癌或乳腺癌，当存在一些合适的、共同的靶点时会使用一些共同的靶向药物。