隐睾术后睾丸萎缩，隐睾本身可能存在睾丸发育不良，特别年纪稍大儿童手术时，睾丸发育不良情况可能更严重。若小时候即出现睾丸发育不良，术后同样可能出现睾丸发育不良。部分儿童术后阴囊外观较大，但并非可能为睾丸组织，可能混杂其它组织。但是随着组织水肿消退后，阴囊即会相应缩小，因睾丸本身萎缩、组织，可通过B超进行观察。
因此，隐睾术后睾丸萎缩，可能睾丸本身较小，且将逐渐变小。如果睾丸并未萎缩，即提示本身发育不良，术后可能逐渐好转。如果儿童睾丸萎缩，最主要可能即本身儿童精索血管可能发育不好，甚至需进行后期手术。只要正确操作，出现萎缩率较低。操作手法不当，可能出现萎缩率较高。
