肝癌微波消融和射频消融都属于物理热消融方法，对于肝癌作用效果相同，都是通过热损伤灭活肝癌。但两者产热原理有所区别，射频消融主要是通过高压电流作用，让肿瘤内部产生热量，从而杀灭肿瘤细胞。微波消融是通过电极产生微波，类似于家里用的微波炉，通过电压改变产热，以此来杀灭肿瘤。

两者都属于微创治疗，但是微波消融效率更高，升温更快，消融范围更大，适合体积较大肿瘤。射频消融升温较慢，消融范围相对较小，但更安全，对于周围有危险器官的情况下应该尽量采取射频消融。总之，两种消融方式都是通过热对肿瘤进行杀灭，手术过程基本类似，唯一区别是两者产热机理存在一定区别。