腭咽弓在口咽，扁桃体的后方。扁桃体在口咽部一边一个，前弓为腭舌弓，后弓为腭咽弓，起到固定扁桃体的作用。

腭咽弓是判断扁桃体大小的指标之一，如果扁桃体还是在腭咽弓里，一般是Ⅰ度肿大的扁桃体。如果已经超过腭咽弓，就是Ⅱ度肿大的扁桃体，如果已经超过腭咽弓，到了中线，就是Ⅲ度肿大的扁桃体。所以腭咽弓是定位扁桃体的一个非常重要的参考标志，也是手术切除扁桃体的非常重要的参考标志。

临床切除的时候，一般是在腭咽弓上方以及腭咽弓跟腭舌弓交界的地方，然后把黏膜切开，扁桃体的上界找到以后，再沿着扁桃体瓣膜，就把扁桃体顺利地切除。

扁桃体也是人体非常重要的免疫的器官，是人体第一道的免疫防线，维护着人体的健康，能够抵御细菌、病毒的攻击。