ERCP作为一种微创手术，费用相对较高，但比外科开刀要低。正常情况下，手术费大概在15000-20000元之间，如果需要应用胆道的金属支架，可能要再高出几千块钱。
因为ERCP也是一种微创手术，而且消化道是有菌性的，为了尽量减少感染以及交叉感染的几率，手术所用的器械均为一次性，且不能消毒使用，如ERCP切开刀、造影导管、导丝、取石球囊、扩张球囊、取石网篮和碎石网篮，均是一次性使用。而一次性器械相对费用较高，而且根据患者的情况不同，有时需要放置支架，如石头过大，不能一次完成，需要放胆道内支架，几个月后进行第二次治疗。另外，部分肿瘤患者，如胆管癌或者胰腺癌失去手术机会，但是患者又出现明显的黄疸或者消化不良症状，需要放置金属支架，费用可能会再高一些。
