丙肝和乙肝都是临床常见引起慢性肝炎的疾病，但病因不同，乙肝由乙肝病毒感染引起，丙肝由丙肝病毒感染引起，乙肝为DNA病毒，丙肝为RNA病毒。两种疾病主要靶器官均为肝脏，引起临床结局相似，如易引起肝炎慢性化，逐渐进展到肝纤维化、肝硬化甚至肝癌。

丙肝病情进展较缓慢，可能需要20-30年会出现肝硬化，但乙肝可能10-20年会进展到肝硬化阶段。乙肝患者肝癌发生率高于丙肝。丙肝应用小分子药物、干扰素进行治疗，可以获得临床治愈。乙肝可以使用干扰素与核苷类药物控制病毒复制，但很难治愈。