肝内胆管结石治疗其实和结石大小关系并不十分密切，主要观察患者有无症状。肝内胆管结石若无明显症状，没有腹胀，腹痛症状，通常只需定期的观察、随访、饮食控制，每半年左右到医院做B超检查结石情况。若一旦出现症状，如有腹胀、腹痛、黄疸、皮肤巩膜黄染，甚至出现发热，这时需进行处理。
处理原则主要有以下几点：
1、取净结石；
2、要解除胆道狭窄，主要因胆道狭窄，胆汁引流不畅导致结石形成。这时手术一定要把狭窄解除，通畅胆汁引流，可防止结石再生。
临床上手术方式主要是胆管切开取石，可能做肝部分切除，还有胆肠吻合术等，这些是较常见手术方式。胆管结石处理相对比胆囊结石处理更困难，但基本上都可处理，患者不必过于担心。
