对于口腔溃疡所导致的头痛，患者应积极治疗口腔溃疡，以减轻由疼痛所导致的头痛等其他不良以及不适症状，必要时可服用止痛药物或使用针刺、外敷等方式缓解头痛。口腔溃疡是局部口腔黏膜疾病，但由于疼痛程度或疼痛面积使单侧神经和血管过于紧张，长时间可能会出现明显头痛或头晕等征象和表现。此时患者不用过于紧张，可选择维生素类药物针对性地治疗口腔溃疡，同时可多摄入多汁、多液的瓜果和蔬菜及富含膳食纤维的杂粮，对于口腔溃疡治疗有所帮助。
此外，患者还可选择热敷、针刺，或使精神放松方式缓解头痛。如果头痛剧烈，则需积极服用止痛类药物以放松神经，同时患者还需保持心情平缓，避免由于疼痛而导致血压升高。另外，患者需注意口腔溃疡可能与白塞氏综合征等血液疾病相关，不能由于口腔溃疡属于小病而忽视，应给予关注和积极治疗。
