为了治疗幽门螺杆菌，医生通常会开出抗菌药物，但是这些药物可能会引起不良反应，具体如下：

1、胃肠道反应：这是最常见的不良反应，包括恶心、呕吐、腹泻、便秘、胃痛，或食欲减退等症状。这些症状通常在开始治疗后不久出现，但通常会在几天，或者1周内消失；

2、过敏反应：少数人可能会出现皮疹、瘙痒，甚至呼吸困难等症状；

3、其他不良反应：如头痛、失眠、肌肉疼痛等，某些抗生素还可能会对肝脏产生影响，导致肝功能异常。

需要注意的是，不同的人对药物的反应不同，一些人可能会对某些药物产生不良反应，而另一些人则可能没有反应。如果在治疗幽门螺杆菌以后出现任何不适，应立即告诉医生，以便他们能够提供适当的帮助和建议。同时应严格按照医生的建议进行服药，不要自行增减或停药。