睡醒腰痛的原因比较多，最常见有两个原因，第一个是腰背部肌筋膜炎，第二个是腰椎小关节功能紊乱。患者出现睡觉之后腰痛，要明确原因，是因前一天出现运动过量、着凉、劳累等情况，还是疼痛时间超过1个月以上。若患者有超过1个月以上的疼痛，需进行腰椎X线片检查，去明确有无脊柱侧弯、有无小关节等功能方面的紊乱或者嵌顿。

若疼痛时间较长，患者可做腰椎核磁共振或腰椎CT检查，去明确有无椎管内腰椎间盘突出问题、有无椎管内囊肿、脊髓内问题等。患者排除以上原因后，可以做相应处理和治疗。