头顶阵发性疼痛的原因较多，常见情况如下：

1、局部因素：局部外伤、肌紧张性头痛、局部肌筋膜炎等；

2、内科因素：血压波动、心律不齐包括心动过缓和心动过速，以及发烧、感染等情况；

3、其他因素：如神经压迫，颈椎椎间盘突出，压迫支配头部的区域神经出现异常。

为明确病因患者需要进行相关检查，如头颅核磁共振、颈椎核磁共振、颈部软组织超声、颈动脉及椎动脉超声等，明确是椎管内外因素，还是颅内外因素。若是偶发或发作时间较短，可通过休息、加强营养、加强锻炼，缓解疼痛症状。若发作时间较长，需要通过影像学辅助检查明确病因，再进行针对性治疗。