从解剖学的角度来讲，上腹部上有胃、十二指肠、胆、胰腺、结肠，这些部位的病变都可以引起上腹部疼痛，所以上腹部疼痛是一个笼统的概念。最常见的是胃、十二指肠溃疡穿孔或胃、十二指肠溃疡疾病，还有急性胆囊炎、胆囊结石、胆管结石、胰腺炎，同时要根据疼痛的性质来决定病变的部位。
胆囊结石、胆囊炎或胆总管结石是在全世界最常见的临床疾病之一，在欧美发达国家其发病率大概在人群中占8%-10%，在中国占7%-12%左右。胃和十二指肠疾病最常见的是胃和十二指肠溃疡，因为胃酸增加以后对胃黏膜或十二指肠黏膜刺激或腐蚀，胃和十二指肠黏膜就会产生糜烂。糜烂以后炎症在向深处波及到肌层，病人就会出现很严重的上腹部疼痛。有时吃完饭以后会疼，饥饿时候胃酸腐蚀到溃疡面也会产生疼痛，所以不同的疾病疼痛性质不是特别一样。欧美国家酗酒比较多，主要是因为酒精引起的胰腺炎也可以引起上腹疼痛。而中国最常见的其实是胆结石，结石从胆囊掉到胆总管，再从胆总管进入十二指肠乳头部位。胰液就会流到胆道或胆汁流到胰腺，继发急性胰腺炎的发作。
