细菌作为病原体有以下情况，一种情况从外界进入人体感染的，一般称为外源性感染，比如有伤口，皮肤破损，这些细菌通过黏膜、皮肤损伤进入到体内繁殖、复制，这个过程称为感染。同时身体会对这种感染的细菌产生免疫反应，体液免疫、细胞免疫反应，这些免疫反应造成身体出现症状和体征，这是细菌感染的过程，这是外源性感染。
除此之外还有内源性感染，人体内实际上也存在大量细菌，比如鼻腔、口腔、消化道都存在大量的细菌，有些是有益的细菌，有些虽然有害，但是在黏膜和免疫作用下，不会造成明显损伤，这是内源带的细菌。这些细菌一旦出现在不应该出现的位置，或者进入到没有细菌的区域时，同样会发生感染。由于细菌本身繁殖损伤机体，免疫反应导致身体产生不适或者症状，这是细菌感染的过程。
