扁桃体是一对椭圆形组织，位于扁桃体隐窝内。扁桃体隐窝指口咽部外侧壁，由腭舌弓和腭咽弓组成三角形区域，扁桃体外周有被膜包绕，其为疏松结缔组织，与咽侧肌肉组织相隔，形成潜在间隙。

当扁桃体炎症控制较差，炎症向周围蔓延时，扁桃体周围间隙可形成感染，此时可出现扁桃体周围炎。扁桃体是咽部淋巴组织的一部分，其本身是淋巴组织团，表面有较多腺窝。急性扁桃体炎发作时，扁桃体腺窝和扁桃体表面，可出现红肿及脓液附着。当有慢性扁桃体炎时，扁桃体腺窝内可有干酪样物质潴留。