治疗肝硬化主要是根据病因采取对症和对因治疗，药物亦是如此。如果是病毒性肝炎引起肝硬化，包括乙肝病毒、丙肝病毒感染，需使用抗病毒药物进行治疗。目前抗乙肝病毒的药物，首选包括恩替卡韦、替诺福韦。有多种抗丙肝的药物可将丙肝病毒完全根治，但乙肝病毒只能通过抗病毒药物抑制病毒复制，无法根治。
若患者已形成肝硬化，则无特殊药物可将其逆转，所以主要应针对导致肝硬化的病因进行治疗，防止肝硬化进一步加重。除病毒外，饮酒、部分药物、自身免疫性肝病、严重脂肪肝等均可能导致肝硬化。所以需严格戒酒，通过饮食控制体重改善脂肪肝。针对自身免疫性肝病，使用调节免疫力及抗纤维化药物，包括中成药，对还没有发展为严重肝硬化的患者或早期肝硬化、纤维化患者，有一定治疗作用。