新生儿心脏间隔缺损分为以下处理方法：

1、等待生长：临床新生儿也见到不少，尤其儿童医院更多一些，此时因为新生儿特别小，除了不是特别特殊，缺损不是很大，房间隔和室间隔，如果缺损有3mm、2mm或者4mm，都会让新生儿再等一等，不着急；

2、手术治疗：如果缺损比较大，4mm以上，室缺5mm、房缺5-6mm，然后新生儿又反复肺炎，甚至有的都没法脱呼吸机，这种新生儿再小、体重再低，也没办法，也必须要做。因为心内分流不解决，新生儿相应的肺部感染、呼吸能力肯定跟不上来。尤其在儿童医院新生儿特别多，低体重儿也多，所以这类新生儿还是主张要积极的手术干预。

其他的缺损不大，分流不明显或者分流量也比较小的，都还是让其继续观察和等待，因为还有自然长上去的可能性。对于大的分流、大的缺损，还是主张尽早去干预。因为不干预，新生儿就没法继续活下去，不光没有生活质量，甚至还会有生命危险。所以就必须尽早地采用适当的方案，解决这些结构缺损。