新生儿拉稀水样便，需注意是否会引起脱水，观察新生儿尿量有无明显减少、眼窝是否凹陷、皮肤是否松弛、前囟是否凹陷等。
若无上述情况，可考虑给新生儿增加喂养、增加水分的摄入，防止出现严重的水、盐、电解质的失衡，从而导致循环衰竭。此时需为新生儿补足营养，增加母乳喂养，适当地添加改良后的口服补液盐进行喂养。
此外，还可使用益生菌与肠黏膜保护剂，可进一步使用改善腹泻症状的药物，如减少肠道分泌的药物。若是细菌性感染，需要进行抗生素的治疗。若是病毒性感染，主要还是以微生态疗法为主，补足新生儿的入量。
病毒感染常有一定自限性，适当地延长观察时间，保证水、盐、电解质的平衡，保护肠黏膜，进行微生态治疗，可以较好地帮助新生儿度过感染期。
