若想要诊断尖锐湿疣，则临床医生的个人经验以及患者的个人性接触病史较为重要，如患者存在典型的尖锐湿疣且明确存在不洁性接触史，则可直接判断。但尖锐湿疣的皮损可能与其它疾病相混淆，此时可以通过辅助手段，如在尖锐湿疣部位取材进行基因检测，即人乳头瘤病毒PCR，以明确是否存在病毒，但可能会存在假阴性或假阳性的问题。

若患者想要明确诊断，可以进行局部皮肤病理检查，将局部皮肤切下并放在显微镜下，可明确是否存在尖锐湿疣的特征性病理改变。同时患者也可通过醋白试验进行检测，将冰醋酸局部湿敷在皮损部位，在数分钟后观察是否已经发生白颜色的改变，但此方法可能存在假阳性的问题。