5-羟色胺属于中枢神经的一种重要的神经递质，主要作用如下：
1、调整睡眠和觉醒：一般具有保持大脑兴奋性，以及保持良好心情的作用。通常在晚上作用于中枢神经的上行网状激活系统，调整睡眠周期，主要包括非快速眼动期的深睡眠，也可调整快速眼动期的做梦阶段，有效的5-羟色胺浓度可以改善睡眠，具有调整生物钟的作用；
2、调整胃肠道功能：从而改善胃肠道作用，比如调整厌食等；
3、其它作用：由于血小板具有止血的作用，另外还可以促进5-羟色胺的分泌，从而调整情绪、睡眠，以及改善饮食和胃口的作用。所以血小板减少时容易引起出血，还易造成情绪低落以及睡眠障碍等。
