甲状腺同位素治疗主要指甲状腺癌或甲亢的碘-131治疗，引起的副作用大不相同，但也有较多共同点，主要包括以下几方面：
1、碘-131治疗后可能会出现颈部肿胀、乏力等一过性反应；
2、碘-131药物口服可能对胃肠道有一过性的刺激，部分患者会出现恶心及呕吐感；碘-131治疗后身体内有一定辐射，可导致排泄物或者分泌物有一定的放射性，对周围人群会有一定影响；
3、碘-131治疗后人体其他的器官比，如泪腺、腮腺等可能会吸收碘-131，导致一过性的损伤；部分患者可能会出现眼干、口干或味觉丧失等情况；
4、部分女性患者治疗后可能会出现月经紊乱，甚至停经等表现，但通常均是一过性表现；经对症处理或及时治疗后，通常1-2个星期即可恢复；
5、甲亢碘-131治疗的副作用是可能会发生甲减，而甲状腺危象等严重并发症极少出现；所以甲亢患者进行同位素治疗后出现高热、心慌、大汗等急性反应，应及时前往医院就诊。