就消毒效果看，碘伏的消毒效果比酒精好一些，但是两者各有优缺点。酒精是一种中效的消毒剂，通过使菌体蛋白凝固变性而发挥消毒作用。
碘伏是碘和表面活性剂结合而形成的不稳定的结合物。酒精只能杀死细菌，不能够杀死芽孢和病毒，而碘伏具有广谱的杀菌作用，可以杀灭细菌繁殖体、芽孢、真菌、原虫，和部分病毒。
75%的酒精可以用于完整皮肤的消毒以及物品表面的消毒，比如肌肉注射前的消毒，但是由于酒精的刺激性比较强，所以不能用于擦伤的皮肤，或者是黏膜和大创面消毒。
而医用碘伏是可以用于一般外伤的消毒，由于医用碘伏的浓度小，刺激性比较小，是可以直接用于皮肤和口腔黏膜处，包括烧伤、烫伤以及擦伤伤口的消毒。
酒精除了消毒之外，还有很多其他的用途，而碘伏基本上只用于消毒杀菌，但是碘伏是不能入眼的，一旦不慎入眼，应立即用大量的清水清洗，然后去寻找医生帮助。
