夜间睡觉后引起腰痛的原因比较多，常见于风湿类疾病，比如强直性脊柱炎或者筋膜炎等其它情况。强直性脊柱炎等疾病，通常夜间睡觉时疼痛加重，或者休息一晚早起腰痛较为明显，活动后腰痛缓解，需要到医院做进一步的抽血和放射科检查，进行明确诊断。

其它会引起晨起腰痛的疾病，比如腰背部筋膜炎等情况，可能与夜间睡眠受凉，以及其它外界因素刺激有关。总体原因较复杂，可以先予以对症处理，需要到医院做进一步检查治疗。