慢性肾盂肾炎的诊断必须依靠病史、症状、体征、实验室检查、影像学检查等来进行综合判断，因此诊断慢性肾盂肾炎的可靠依据不是单一的，它是一个综合性判断。
慢性肾盂肾炎是泌尿系统的一种，它属于上尿路感染，肾炎如果每年发的速度≥3次，或者每半年发的速度≥2次，就称为慢性肾盂肾炎。慢性肾盂肾炎在诱因的情况下，例如喝水少、劳累、憋尿，或者某些原因造成机体免疫力下降，容易出现急性发作。
急性发作的临床表现和急性肾盂肾炎类似，容易出现尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激征，可以出现尿中带血的情况，可以出现腰疼、叩击疼，血中可以出现白细胞增加，以及中性粒细胞增加。
尿液检查可以出现白细胞升高，以及均一性红细胞的增加，体温可以升高，最高可以达到39℃以上。而泌尿系统彩超可以显示肾盂、肾盏黏膜增厚，或者充血情况，严重的可以出现轻度肾脏积水。
