肛管癌和直肠癌的区别主要是发生部位不同，肛管癌指齿状线以下到肛门这段较短距离发生的肿瘤。而直肠癌指齿状线以上，一直到直肠及乙状结肠交界部位，这段肠管所发生的恶性肿瘤。因此肛管癌和直肠癌的区别主要是发生病变部位不同，以齿状线分界，齿状线以下是肛管癌，齿状线以上是直肠癌。

患者的症状大部分可相似，不论是肛管和直肠癌均以便血情况最为常见。肛管癌坠胀感比直肠癌更加明显，因离近肛门口。因此在此位置长肿瘤时，患者会有更明显的肛门堵塞感和坠胀感。