小儿麻醉期间，心率、心律及血流动力学改变较呼吸系统的影响少见。正常婴儿应用阿托品后心率可以增快达到180次/分，一般情况下并没有不良后果。麻醉期间心率减慢，可能是低氧血症、迷走神经刺激或者心肌抑制所致。小儿麻醉时出现心动过缓则提示有危险性因素存在，因幼儿对缺氧、失血等代偿能力比较差，没有及时治疗可能会导致心脏骤停，心脏骤停则是麻醉期间最严重的并发症。
小儿麻醉期间体温也会发生变化，1岁以下的婴儿麻醉期间体温易下降，1岁以上的幼儿麻醉期间体温易升高。中枢神经缺氧可以是麻醉期间缺氧造成，由于麻醉技术进展，目前已很少发生此情况。
周围神经损伤通常是体位不当所致，上肢外展过度可以造成臂丛神经损害，腓总神经也可以由体位压迫而损伤，均应注意避免。因患儿对麻醉代偿能力有限，麻醉期间必须严密观察。若能在出现异常反应早期及时发现、处理，很多并发症可以避免。
