肝萎缩是否能治好取决于多种因素，如引起肝萎缩的病因以及肝萎缩的严重程度等。如果是乙肝、肝硬化导致的肝萎缩，一般属于肝硬化的中晚期，肝脏整体出现了大量的细胞坏死、异常的增生，肝脏会呈现萎缩的状态。这种情况下的肝萎缩往往治疗困难，一般无法逆转，积极地抗病毒、保肝、对症处理，只能够延缓肝硬化的进展。
某些肝内胆管结石会引起区域性的肝萎缩，只需要进行萎缩部位的肝脏切除并取尽结石，就能够治愈。肝萎缩局部也应该切除，因为肝萎缩是属于肝内胆管癌的癌前病变，尽早地切除能够有效地预防癌变。
另外也要取决于肝萎缩的程度，针对严重的肝萎缩，肝脏会出现功能的完全异常，从而进入严重的失代偿期，出现严重的并发症，这种情况下只能考虑肝移植，能够有效地替换肝脏，达到好的治疗目的。肝移植目前五年的生存率可以达到80%以上，所以是较为有效的治疗方法。
