肛瘘基本无法自愈，只能手术治疗。患者容易将肛瘘暂时性愈合误认为自愈，实际上后续依然会反复发作。患者不要抱有侥幸心理，肛瘘无法自愈，只能经过手术治疗，且越早治疗越好。如果是单纯的低位肛瘘，反反复复发作、发炎，容易导致瘘管特别多，支管特别多，位置越来越高。开始可能只涉及小部分括约肌，后来所有括约肌环都会涉及，从而形成高位肛瘘，导致治疗困难。

综上所述，建议肛瘘患者在早期较轻、较初期时及早进行治疗，因为高位复杂性肛瘘治疗起来非常困难，而且术后对于肛门功能的损伤较大。