肛瘘术后复发率无法一概而论，主要根据肛瘘具体情况，比如是低位单纯性肛瘘还是高位复杂性肛瘘。高位复杂性肛瘘术后报道甚至有15%以上复发几率。但小儿肛瘘往往以单纯性低位肛瘘多见，因此小儿肛瘘手术后复发率比成年人低很多，因此各位家长也不必担心。

如果是低位单纯性肛瘘需要到正规医院就诊，由富有经验的肛肠专科医生实施手术，在手术过程中准确找到感染肛腺即内口，术后并给予适当处理，几乎不会复发。如果是高位复杂性肛瘘，即使到正规医院由有经验肛肠科专科医生实施手术，仍有一定复发几率。