复发性流产的病因非常复杂，目前已知的病因包括解剖因素、遗传因素、内分泌因素、感染因素、易栓症、自身免疫性疾病，还有不良的生活习惯或者男方因素，也可以引起复发性流产。此外，还有一部分复发性流产的原因并不是很清楚。因此，首先要对复发性流产的患者进行病因筛查，然后才能进行针对性的治疗。
子宫颈机能不全，可以进行子宫颈环扎术，子宫畸形可以进行手术治疗；有一部分流产，是因为甲状腺功能减退引起的，需要接受甲状腺激素治疗。待甲状腺功能恢复正常至少3个月之后再怀孕，并且孕期还要坚持用药和监测；感染因素引起的流产，必须在孕前根据病原菌进行针对性治疗，等感染控制之后才可以受孕；免疫因素引起的复发性流产，需要根据免疫紊乱的类型采取针对性的治疗方案。
因此，复发性流产的患者，一旦怀孕，整个孕期还要进行严密监测和适当治疗。