髓母细胞瘤通常属于胚胎性高度恶性肿瘤，目前尚无法完全根治，但经过近10-20年的综合努力、科技发展以及治疗手段的进步，髓母细胞瘤预后较以前有明显改善，五年生存率可达到30%-40%，但还达不到根治。髓母细胞瘤属于恶性肿瘤，复发后会可能会迅速恶化，预后较差。

髓母细胞瘤有些恶性程度较高，根据分子类型分成四型，即Group3、Group4、SHH型、WNT型。效果最好的是WNT型，该类型的五年生存率达50%-60%，所以是预后最好的类型，但是不管怎样，迟早都会复发，但能通过目前手段延缓其复发，手术后病情恢复、稳定，尽早做放疗、化疗，要长期严格随诊。