目前在脑内的所有肿瘤中脑干胶质瘤最常见，脑干胶质瘤属于神经上皮肿瘤，目前病因并不清楚，但有一部分肿瘤跟遗传因素密切相关，所以胶质瘤应该是内在因素、遗传因素、外在因素，比如物理、化学因子共同作用、诱导基因突变出现的情况。

脑干胶质瘤属于多因素作用的结果，但因为胶质瘤整体类型较多，所以具体病因目前还不清楚。