孩子如果间断性咳嗽二十几天，有可能是反复感染引起，也有可能是一次的感染没有完全控制住，需进一步明确病因。如果考虑是感染引起的咳嗽，可进行相关的病原体检查，如呼吸道病毒检测、痰培养检测、痰真菌培养检测。同时还要进行炎症指标的检测，如血常规、C反应蛋白、降钙素原的检测，进一步明确是病毒感染还是细菌、支原体、衣原体感染。
如果明确是细菌感染，可以根据痰培养药敏结果，选用抗生素进行抗细菌治疗。如果是病毒感染，通常以对症支持治疗为主，可以选用止咳、化痰药物，口服或雾化吸入，必要时可静脉输液治疗。如果明确是支原体、衣原体感染，可以选用大环内酯类药物进行治疗。如果明确是真菌感染，可选用抗真菌药物进行治疗。
如果考虑非感染性咳嗽，如咳嗽4周以上，且以早晚咳嗽、干咳为主，经过抗感染治疗无效，则必要时还要进行过敏原、 肺功能、呼出气一氧化氮等相关检测。如果明确是咳嗽变异性哮喘，或过敏性咳嗽，还要使用抗哮喘、抗过敏药物，进行对因治疗。
