拔除智齿的原因是，有很多情况下，智齿的存在会对牙齿健康、口腔健康或者甚至身体健康，产生不良的影响。智齿是第三磨牙，最后一颗萌出的牙齿，因为人类进化以后，食物的结构越来越精细，颌骨受到咀嚼力的刺激在减少，所以颌骨的骨量在减少，而牙齿的牙量并没有减少，牙量和骨量就产生了不协调。
作为最后一颗萌出的牙齿，往往在萌出的时候，没有足够的空间，就造成大量的智齿会产生阻生的情况。这种阻生的智齿表面的牙龈覆盖，牙龈和智齿之间会形成盲袋样结构，容易积存食物残渣、细菌，很容易产生冠周炎的反复发作。阻生的智齿，顶着前面的第二磨牙，导致第二磨牙远中面容易产生龋坏，深的牙周袋危及第二磨牙的健康。有些智齿完全阻生，长不出来，周围还会形成牙源性的囊肿和牙源性的病变，带来的危害会更大。
所以，正是因为有这种智齿不能完全萌出，产生的相应一系列病变的可能性。所以在智齿将要萌出的时候，通过检查证实有阻生的情况发生，或者在萌出的过程中，已经产生明显的肿痛，或者是牙源性的病变，一旦发生要及时地发现，及时把智齿拔除，避免严重的问题发生。
