流感特点为容易继发细菌感染，尤其是肺炎链球菌感染。如果流感患者后期咳脓痰，通常提示患有细菌感染，主要治疗如下：

1、应用针对抗肺炎链球菌药物，如阿莫西林克拉维酸钾或三代头孢等，进行抗菌治疗；

2、使用一些化痰类药物，像氨溴索或乙酰半胱氨酸等，起到化痰目的。

对于流感后咳嗽，应用抗菌药物进行病因治疗较为关键。因流感于肺炎链球菌具有协同致死作用，后果较严重，需引起重视。