总体而言，经二代试管婴儿出生的胎儿与自然妊娠的新生儿在畸形率方面并无差异。但部分研究表明，选择进行二代试管婴儿的患者通常为严重少弱精男性，而此类患者自身存在遗传学异常，因而会携带少弱精基因。

此外，二代试管婴儿出生的男宝宝长大成人后可能受男性不育困扰，但此类现象发生并非该技术所造成，而是由婴儿父亲携带男性少弱精基因所致。因此，在遗传学背景下，可能存在少弱精症基因遗传现象。