牙拔除后，骨组织和软组织受到不同程度的损伤，创伤造成的代谢分解物和组织应激反应产生的激活物，刺激神经末梢引起疼痛。除创伤外，过大的拔牙创伤，凝血块的脱落分解，使牙槽骨壁上的神经末梢暴露，受到外界的刺激，也可能会引起疼痛，通常像阻生齿拔除后常会出现疼痛，因此术后需常规镇痛治疗。
这种疼痛术后当日即可出现，拔牙创口多正常，即使拔牙创口空虚，无腐败坏死的组织，疼痛不严重，3-5天内会逐渐消失。如拔除智齿后2-3天以后，还有剧烈的疼痛，或疼痛又加重了，并且向头顶部、下颌下区放射，止疼药不能止疼，拔牙窝内空虚或者是有腐败变性的血凝块，有异味，异味强烈，则需要及时就医，通常及时处理以后10天左右疼痛会逐渐消失。因此，医生会尽量减少手术的创伤，保护拔牙创口内的血凝块，而且患者一定要尊重医嘱，如拔牙当天不要漱口。
