脸上长的黑痣医学上称为黑素细胞痣或者痣细胞痣，主要由于先天胚胎发育期间，黑色素细胞从神经嵴向表皮牵引的过程中，受到某些偶然因素干扰不能正常迁徙，在皮肤中局部聚集成团块形成色素细胞痣。聚集成团的色素细胞不一定出生时就有合成黑色素的功能，所以局部颜色不明显，肉眼也不能觉察到局部有痣。

随着年龄增加，皮肤长期受日光紫外线照射或者体内激素水平波动，刺激黑色素细胞功能。痣细胞中黑色素细胞就开始合成黑色素，肉眼可以看见局部逐渐长出黑色小斑点，就是黑痣。所以脸上长黑痣根本上还是先天发育期间形成，只不过可以在后天逐渐显现出来，多数黑痣都属于良性病变，一般不需要特殊处理。