多数医院妇产科的检查通常使用阴道B超来检查生殖器官的情况，阴道B超通过阴道探头来检查。一般而言，阴道B超可以检查阴道、宫颈、子宫，以及输卵管、卵巢的情况，有时也可以检查盆腔的情况。

阴道B超的好处相对于腹部B超而言，检查女性生殖器官更为清晰，腹部B超则需要膀胱充盈，也就是憋尿下进行，膀胱充盈得不好，生殖器官显示得就不清。尤其是在观察子宫内膜和卵巢的情况时，腹部B超有很大的缺陷，有时可以检查不完全。

阴道B超则需要排空膀胱，因为其间隔仅是腹膜，最直接地可以观察到子宫内膜和卵巢的情况。另外，阴道B超受结婚、以及性生活的影响，如果没有性生活，不能做阴道B超，可以改做经直肠B超检查，经直肠的检查与阴道B超有相同的功效。