有文献报道减胎术后流产率为6%-22%不等，一般认为与采取的手术方法、时间等有关。减胎术后的流产，部分患者并不是在手术后马上发生，而是发生在手术后较晚的时间，有的甚至间隔1-2个月。术后较晚的流产机制还没有明确，可能的原因是胚胎本身发育异常，到了一定妊娠时间发生胚胎停育，与手术无关。有报道称有3/4的染色体非整倍体引起的流产发生在怀孕8周前，而染色体整倍体的流产高峰是在怀孕13周。其次，推测可能是机械破坏引起的非特异性炎症或者穿刺继发的感染导致流产发生。有研究表明实施减胎术后的妊娠结果与术后分娩的胎数有关，即减胎后留下单胎的妊娠结果比双胎好。减胎数并不增加妊娠期产科并发症的发生率，熟练的多胎妊娠减胎术是一种比较安全且创伤较小的，可以有效改善多胎妊娠结果的方法。
