脑外伤后三个月仍然没能够清醒，说明患者的意识恢复情况不太理想，同时外伤本身所造成的损伤比较严重。对于这种情况，可以采取以下措施进行治疗和调整：

1、加强康复治疗继续促进患者的恢复，比如进行高压氧治疗等，可以促进神经细胞功能的恢复；

2、复查头颅CT或者磁共振，明确患者是否发生了外伤之后的脑积水。因为外伤之后，特别是重型颅脑损伤之后常发生脑积水，而此时如果有脑积水，患者的意识障碍会有所加重，短时间内不容易清醒。如果可以通过神经外科手术的方式，进行脑室腹腔分流手术，把脑部多余的积水引流到腹腔里，促进脑脊液吸收，患者脑积水的情况得到改善之后，对意识的恢复非常有帮助；

3、即使进行了有效的治疗和康复之后，仍然不能有效清醒的患者，在后续的治疗过程中，可以考虑经颅电刺激、脊髓电刺激等方法，来帮助患者恢复一部分意识功能。