子宫内膜异位症属于临床诊断，患者会表现为痛经、盆腔痛、性生活痛，甚至不孕。医生根据上述临床表现，结合查体、辅助检查，如B超检查，可以诊断子宫内膜异位症。

如果卵巢存在巧克力囊肿，则进一步证实子宫内膜异位症的诊断。而对于卵巢囊肿，即巧克力囊肿，建议进一步进行手术探查；如果并没有卵巢囊肿，建议先通过应用药物进行保守治疗。