小儿阴茎短小是发育过程中的一个过程，但并不是结果。确认小儿阴茎短小首先要排除阴茎先天性发育异常，比如尿道下裂、隐睾等。隐睾会引起性腺功能不良，造成阴茎发育延迟，出现阴茎短小。如果排除上述情况，1-10岁之间的小儿阴茎短小不需要治疗。如果男孩超过14岁，外生殖器还是没有变化，阴茎外观、阴毛没有发育、色素没有进一步加深，这时要带着小孩到医院去看，确定是不是有异常。
小儿在1-10岁之间，尽管阴茎短小或者外观短小，也不需要特殊处理，但应该注意影响阴茎外露的因素，比如肥胖。现在随着生活水平的提高，儿童营养现在都非常好，很多时候会出现营养过剩，引起小儿肥胖，造成耻骨前脂肪偏多，这种脂肪增多会使包皮向远端移位，使阴茎显得更加短小。所以1-10岁之间要注意儿童体重不能过重，要积极引导儿童锻炼。很多儿童进入青春期后，如果不是特别肥胖，外观的短小一般会逐步缓解。