CT平扫和三维重建的区别主要有以下几点：

1、CT平扫：获取的是原始数据，可以是横切的水平位，也可以是矢状位和冠状位，多数时候可以很好地建立疾病损伤及对比关系。但是CT平扫对于特殊的部位，如气管和气管拐弯处、肋骨折断后的错位情况，还有其他地方的骨骼或肠腔器官的内部结构，不是特别清楚。所以需要三维重建来还原器官立体处的表现，所以心脏造影、大脑血管造影、气管立体的三维重建、骨骼的三维重建就应运而生；

2、三维重建：是基于平扫和各种冠状位、矢状位及水平位的数据，用后期电脑重新合成的数据。将获取的冠状位、矢状位和水平位的数据整合后还原出器官三维立体的形象，可以直观地看到何处有病变，而且根据血流的多少添加色彩，看起来就更加直观。