所有手术都需要切皮和刺激末梢神经，阴茎分布的神经末梢较多，儿童越大神经系统发育越好，手术后疼痛感觉越明显，较小儿童术后阴茎痛感可能比年龄较大的儿童少。

早期手术可以减少术后疼痛发生，但阴茎疼痛以及勃起都不利于术后恢复。持续镇痛泵的使用以及短效止痛药物应用，可以有效改善患儿术后疼痛状态以及疼痛症状，有利于切口愈合与疾病康复。